대량으로 SNP를 Genotyping하는 플랫폼으로는 일루미나와 써모피셔가 있다. 써모피셔의 Microarray Genotyping 칩 이름이 Axiom인 것으로 보인다. Axiom 칩으로 Genotyping 했을 경우 gentotype을 구하는 방법을 설명한다.
실험을 하면, 실험의 결과로 cel 이란 확장자를 가진 파일들이 생긴다. cel 파일을 읽어서 genotype을 결정하려면 cel 파일을 읽는 프로그램이 필요하다. 그 프로그램이 Axiom Analysis Suite이다. 줄여서 AxAS라고 하는데 발음이 쉽지 않다. 암튼 먼저 Axiom Analysis Suite를 설치하는 방법을 설명한다.
참고 글
https://blog.naver.com/iq6000/223727472278
20250116_Axiom Analysis Suite 메뉴얼 (3) - 써모피셔 프로그램 설치(AxAS, AxLE, SSP Tool)
자체적으로 CEL파일을 읽어야 할 때를 대비해서 지노타입을 확인할 수 있는 프로그램들과 지노타입 확인...
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