Final Report 다운로드 하기(개체 이름 템플릿 작성)

지금까지 Genotype Data를 다운로드하는 형태는 기본적으로 사각형 방식이었다. 기본적으로 열(또는 행)에 개체가 있고, 행(또는 열)에 SNP가 있는 형태였다. 그런데 일루미나 사의 지놈스튜디오는 한 개체의 한 SNP가 한 행을 차지하는 출력형태를 지원했다. 지놈스튜디오에서는 Final Report라 불려졌다.아마도 Axiom Analysis Suite는 이러한 Final Report 형태의 출력을 처음부터 지원한 것은 아닌 거 같다. 그러니 Axiom Analysis Suite 프로그램에 Final Report 출력 기능이 포함된 것이 아니라 Axiom Long Export Tool 이라는 외부 프로그램에 이런 기능이 있는 것으로 보인다. 그런데 이렇게 되니 불편한 점이 생겼다. 이미 Axiom Analysis Suite에 Alternate Sample Name을 넣어 놨는데, Axiom Long Export Tool에서는 이것을 이용하지 못해 다시 템플릿을 다시 만들어 주어야 한다. 짜증이 나지만 어쩔 수 없으니 Axiom Long Export Tool에서 사용할 개체 이름 템플릿을 만들어 보자.

(cel 파일 이름에 개체 이름이 있을 경우 개체 이름을 추출하는 방법에 대해서는 맨 아래에 있는 링크 참조)

 

 

Axiom Analysis Suite에 개체 이름 입력하기, cel 파일 이름에서 개체 이름 추출하기

2024.10.31 - [Animal Breeding/Axiom Microarray Genotyping] - 개체 이름으로 Genotype 다운로드 하기

개체 이름으로 Genotype 다운로드 하기