PEDIG의 ngen

PEDIG의 ngen

 

 

 

ngen.f 프로그램은 알려진 조상의 수, 세대 당 알려진 조상의 비율, 그리고 the number of equivalent complete generations traced(각 세대 당 알려진 조상의 비율을 전 세대에 걸쳐 합한 것)을 계산한다. 이 통계량은 성별로 생년별로 제공한다. 이 통계량은 최소한 한 부모라도 알고 있는 개체에 대하여 계산한다. 선택적으로 처음 8 세대의 알려진 조상의 비율이 각 개체에 대하여 결과 파일에 저장된다. 이러한 정보는 개체 또는 연도 사이에 근교계수를 엄격히 해석하거나 계산할 때 또는 같은 양의 혈통 정보를 가진 개체에 대해서 근교계수를 계산할 때 유용하다.

 

 

 

 

 

 

 

 

ped_util에서 만든 혈통 파일을 입력한다.

 

 

 

ngen이 분석한 결과를 저장할 파일을 입력한다.

 

 

 

다음은 결과 파일의 일부이다.

 

   60862 1.0000000 0.5000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
   60863 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
   60864 1.0000000 0.5000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
   60865 1.0000000 1.0000000 1.0000000 0.2500000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
   60866 1.0000000 1.0000000 1.0000000 0.1250000 0.0937500 0.0468750 0.0000000 0.0000000
   60867 1.0000000 1.0000000 0.2500000 0.1250000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
   60868 1.0000000 1.0000000 0.5000000 0.2500000 0.0625000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
   60869 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000

 

60866은 최대 6대 조상까지 알고 있다는 의미

 

각 세대의 알려져 있는 조사의 비율이 나와 있다.

 

1대는 대부분은 알려져 있으나, 2대 또는 3대는 모르는 개체부터 반만 아는 개체, 전부 아는 개체 등이 있음을 알 수 있다.

 

홈페이지에서 다운로드 받은 프로그램은 99999두까지만 표시를 할 수 있었다. 그 이상이라면

 

 ***** 1.0000000 1.0000000 1.0000000 0.1250000 0.0937500 0.0468750 0.0000000 0.0000000

 

이렇게 표시가 된다.

 

그러면 소스를 열어

 

c   8 format (i5,8f10.7)
c number of animal exceed 99999
    8 format (i8,8f10.7)

 

8 format (i5,8f10.7)를 찾아서 코멘트 처리하고  8 format (i8,8f10.7)로 바꾼다.

컴파일하고 다시 실행한다.